保罗的书信中有三卷书信是在同一时间写的，由同一名信差叫推基古的，送到同一个地区。这三封信中的第一封是给腓利门的信，那是保罗写的第一封短信，谈到一名脱逃的奴隶；接着他写了《歌罗西书》，因为歌罗西教会出现了一个危机；再来他写了一封一般性书信，被称作《以弗所书》，这封信原本没有标明地址，在早期的手抄本中并没有出现以弗所这个地名，可见是一般性的书信，最后传到以弗所就留在了那里，所以这三卷书信的性质有所不同。《腓利门书》很短，不用花太多时间，但是这卷书很温馨，在新约圣经中只占一页。可惜保罗书信的顺序编排得并不好，跟旧约圣经中的先知书一样，我们如果看旧约圣经就会知道，篇幅长的都排在前面。
保罗书信分成两大部分，分别是给教会的信和给个人的信。这两种都是篇幅长的排在前面，篇幅短的排在后面，这样编排并不对。所以，我们最好按正确的顺序来读，先读《帖撒罗尼迦前后书》，然后是教牧书信，《提摩太前后书》和《提多书》要放在最后，我们应当按这个顺序来读才正确。可惜的是，编排圣经的人把《罗马书》放在了教会书信的最前面，因为它最长，最后几卷短书是《帖撒罗尼迦前后书》，再来是写给个人的信，《腓利门书》被放在了最后，因为它最短。但短并非代表不重要，能被收录在圣经里，就说明了它的重要性。圣经里的每卷书都很重要，因为它们都是被上帝看重而编辑在一起的。虽然《腓利门书》是最短的一卷书信，但这卷书却很重要。 《腓利门书》完全是在谈某个人的事，一个逃走的奴隶，算得上是私人信件，所以我们要问两个问题：第一、保罗为什么要写这封信？答案其实很明显。第二、为什么上帝把这封信放在圣经里？这不是一封私人的信吗？不是在谈某个人的私事吗？
这封信只有一页，写在一张简单的薄纸上，象是保罗写给腓利门的一张短笺。这封信的内容其实很单纯，是在讲一个人的事儿，这里讲的是一个奴隶工作不力、偷懒、抗命、怨恨，甚至最后决定逃走。逃走的奴隶得找个地方躲起来，最好的地方就是大城市，城市越大越容易避人耳目，所以这个奴隶跑去了罗马。在前途茫茫之中，不知道怎么搞的，他竟然结识了和罗马士兵铐在一起的保罗，这不但要命，还改变了他的命运。在当时，逃走的奴隶会被钉在十字架上处决，但是主人如果特别慈悲，会用一块上面有一个“F”的烙铁在他的额头上烙印，“F”这个字的意思代表的是“在逃”，这个记号会跟着他一生，带给他很多麻烦，但是这已经是最好的结局了，最坏的结局是被钉在十字架上处死。结果他认识了保罗，信了主，他本来是要逃到罗马躲起来，但是保罗说他应该要回到他的主人那里去。
有很多人以为信主以后，成了一个新造的人，就可以逃避过去。不是的，反而应该要好好弥补过去的错，有太多人以为信主以后，就可以把过去忘得一干二净，这样是不行的，上帝要你尽量弥补过去的错，这是悔改中很重要的一部分，悔改包括补偿、弥补过去的错。就象你不能够去跟银行说：嗨，当初跟你们贷款的那个人，已经和基督一同钉十字架死了，基督在加略山上已经为我偿还了所有的债，我自由了，现在是个新造的人。你不能这么做，也不能够因为信主就逃避婚姻或者离婚，那样想是不对的。你成了新造的人，现在可以好好地去找答案、解决问题了。就象当初撒该并没有对耶稣说：喔，耶稣，我已经改变，我不会再骗别人的钱了，从今以后我要在金钱上诚诚实实的。他不是这么说的，他反而说：我过去骗过谁的钱，今天要连本带利还给他，免得亏负了别人。耶稣回答说：今天救恩临到这个家了。撒该没有逃避过去，他面对过去，努力弥补。所以悔改的真正意思是，弥补过犯不逃避。
保罗对这个逃走的奴隶阿尼西母说，我得送你回主人那里。但是真的很奇妙，一定是上帝在动工，阿尼西母的这个主人也是一个基督徒，住在歌罗西，保罗说：我会写一封信让你带回去给他。于是保罗写了这封感人至深的信，这卷书信里有个双关语，就是“阿尼西母”这个名字。阿尼西母的意思就是“有益处”，这是他的主人给他取的名字。保罗对腓利门说：你以前也许觉得他没有用，但是我现在要送一个有益的奴隶回去给你。这里巧妙地用这个名字做了双关语。他现在不但对你有益处，还是你的一个弟兄，他从你那里偷走的钱，我会替他还上的，这是我亲笔写的信。于是，保罗差阿尼西母回去。这件事可以从许多角度来看。从个人角度来看，保罗恳切地请求腓利门，说：我年纪大了，还下在监里。保罗以长者的身分为阿尼西母求情，这是一封真情流露的信。而腓利门呢？教会就在他家聚会，他的妻儿也都参与了事奉，保罗说：这对我们三个人都是一件难事，我舍不得让他走，我很珍惜他，而你会觉得很难接纳他和原谅他，但是我们应该去做这件困难的事。
这封私人书信充满了关爱，是一封爱的书信。从社会角度来看，保罗并没有设法从外部废除奴隶制度，他是从里面来废除，设法改变他们的关系还有态度。阿尼西母现在是你的弟兄，不再是你的财产，乃是在主里亲爱的弟兄。就是这样的态度，最后终于打破了奴隶制度，把奴隶当作弟兄来看待。众所周知，有两种方法可以对抗社会的败坏面：一种是使用武力来击倒它；另一种是用爱从内部来瓦解它。保罗选择了第二种方法，用爱来解决问题。有些人批评保罗姑息奴隶制度，这种说法根本是大错特错。保罗在《提摩太前书》中说到，杀害父母的子女跟贩卖奴隶的人，都是上帝所不喜悦的。有些人批评新约圣经没有谴责奴隶制度。保罗确实反对奴隶制度，他没有姑息，只是他的处理方式不同寻常而已。
这卷书信之所以被放在圣经里，是因为它清楚描绘了我们的救赎。因为我们就是那个奴隶，我们逃离上帝，对上帝没有用处，有人为我们偿还了我们的债务，并且把我们送回到上帝那里，让我们做个有用的仆人。是谁帮我们还了欠债呢？是耶稣。所以圣经说，我们是被重价买赎回来的。是耶稣用他的宝血和生命把我们从为奴之地赎了回来。我们因此拥有了永恆的新生命，我们也从奴隶而变成了自由人。我们拥有了不犯罪的自由。当我们被圣灵充满，我们就不再犯罪了，所以我们要天天作感恩的祷告，让圣灵充满我们每一天。在这封短信里，我们可以清楚看见我们的救赎，我们逃离上帝，对上帝没有用处，但是耶稣阻止了我们继续逃走，祂改变我们，把我们送回到上帝那里，让我们成为有用的仆人。
《腓利门书》有一个道德的层面，因为它谈到了保罗为这个奴隶的付出，完全就是耶稣对保罗的付出。它的信息是，耶稣怎样为我们付出，我们现在也要怎样为别人付出。耶稣为我们还债，拯救我们，把我们回收，送我们回到天父那里去服事，现在我们也要为别人做这些。耶稣怎么样对侍我们，我们就要怎么样去对待别人。我们要去把人回收，送回到天父那里，我们必须愿意为他们付代价，正如耶稣为我们付代价一样。保罗所要表达的是，基督对他的救赎，成了他奉行的生活方式。基督怎样对待他，如今他也要怎样去对待别人。这里是一个很完美的榜样，教我们如何做成得救的工夫——亲爱的腓利门，我现在要把他送回去，你会发现他对你有用处。耶稣在天父面前也是这样说我们的——天父，你会发现他们对你有用，你会再度觉得他们有用处，我要把他们送回去，他们的生命已截然不同了，他们现在是我们家中的一分子了。